９日午後４時半ごろ、那覇空港で国内線搭乗の保安検査を済ませた乗客全員の検査をやり直すトラブルがあり、数時間にわたって国内線の出発を一時見合わせた。航空各社によると、全日空の石垣、鹿児島行きなど計５便が欠航したほか、全日空や日本航空の羽田、福岡行きなどに遅れが相次いだ。

　　国土交通省那覇空港事務所などによると、石垣島から東京への乗り継ぎで到着した中国人女性３人が、空港内の免税店を探している途中、誤って１階の手荷物受取所に入り、再び２階の発着ロビーに引き返したのが原因。荷物から刃物などを取り出したり、別の出発客に渡したりすることも想定できたため、やり直した。